Questa è la versione di The Legend of Zelda The Minish Cap venduta in Giappone, il suo titolo originale è stato "Zelda no Densetsu: Fushigi no Boushi" ed è stato rilasciato all'inizio di novembre 2004. Oltre ad avere un'arte diversa dalle versioni occidentali come è abbastanza comune, i risvolti di questa edizione sono molto belli e mostrare dettagli aggiuntivi.
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